Het voorkomen van besmetting door tijdelijke afzondering. De meeste ➛infecties worden door introductie van nieuwe dieren of planten veroorzaakt.
Voor aquariumdieren kan daarvoor een apart aquarium handig zijn, quarantainebak genaamd. Dit is een klein aquarium waarin dergelijke nieuwe ➛aanwinsten ongeveer een maand kunnen worden gehouden om de al aanwezige dieren te verlossen van ongewenste 'bijproducten' als parasieten, slakken, hydra's, etc, en om vast te stellen of de dieren zélf gezond zijn, alvorens deze in het doelaquarium te plaatsen. Ook voor de behandeling van zieke dieren geeft deze afzondering meerdere voordelen.
De grootte van een dergelijk aquarium hangt af van de grootte van de gekochte of gehouden dieren. Helemaal verantwoord hoeft die grootte niet te zijn: het gaat slechts om een tijdelijk verblijf. Verder zijn de eisen aan het aquarium overzichtelijk. De bak zelf kan een oud of tweedehands aquarium zijn. Een eenvoudig ➛sponsfilter en ➛verwarming volstaan. Basisverlichting geeft beter zicht op de inhoud, maar hoeft niet en een kap kan dan achterwege blijven. Een afdekruit is wel aan te raden tegen verdamping en springlustige dieren. Plaats een quarantainebak bij voorkeur op een rustige plaats, zodat ➛stress uitblijft, of dek enkele ruiten met donker papier of folie (plastic zak) af.
Een quarantainebak hoeft niet permanent draaiend te worden gehouden. Eenmaal draaiend mag het geen verbinding met het doelaquarium hebben, maar het is wel belangrijk dat het water erin een vergelijkbare kwaliteit heeft. Vul het eventueel voor een deel met water uit het doelaquarium. Het opstarten van een quarantainebak vraagt als elk aquarium een periode van ➛rijpen. Dit kan worden versneld met bodem- of filtermateriaal uit het eigenlijke aquarium, zodat dit proces hooguit een kleine twee weken kost. Dit betekent wel enige planning alvorens nieuwe aanwinsten te kopen. Controleer het water alvorens er dieren in te plaatsen. Geef het aquarium het gebruikelijke ➛onderhoud, met regelmatige ➛waterwissels.
De inrichting kan het best eenvoudig worden gehouden, met eventueel een dun laagje donker grind, indien nodig enkele schuilplaatsen en uitsluitend echte ➛waterplanten.
Nieuwe dieren kunnen aldus worden gecontroleerd op eerder genoemde ziekten, parasieten en andere ongewenste meekomers. Ook nieuwe planten kunnen in quarantaine worden gehouden om deze slakvrij in het doelaquarium te kunnen planten. Eventueel kan de temperatuur geleidelijk worden opgevoerd naar 30° en na vijf dagen weer naar normaal worden afgebouwd. Veel parasieten overleven die temperatuur gedurende een dergelijke tijdsduur niet. Ook voor vissen is dat zwaar, maar levert geen problemen op. Voor koudwatervissen is deze behandeling niet altijd aan te raden. Zorg in ieder geval voor voldoende ➛zuurstof, bijvoorbeeld met ➛beluchting.
Zieke vis kan afzonderlijk worden behandeld, zodat gezonde dieren in het doelaquarium niet met medicamenten hoeven te worden belast. In het kleinere quarantaine aquarium is ook nog eens een lagere dosering nodig, wat kosten scheelt. De extra rust zonder soortgenoten kan ook gunstig zijn.
Overbrengen naar het doelaquarium kan als gebleken is dat geen problemen optreden. Verleng het verblijf daarom tot deze zijn verholpen. Plaats dieren altijd met de nodige zorg over, zeker zieke dieren, bij voorkeur met de ➛druppelmethode.
Houdt er rekening mee dat het terugplaatsen vanuit een langer durende quarantaine een vis de bestaande hiërarchische plek in de groep kan kosten.